吴中人民医院消化科是苏州市临床重点专科，科室由消化内科及消化内镜中心两部分组成。科室现有主任医师3名，副主任医师1名，主治医师、住院医师10名，其中硕士研究生8名，科室设置床位30张。
消化科年门诊量超过5万人次，年胃肠镜检查量超过1万人次，其中无痛镜检查比例超过50%，常规开展各种内镜下治疗，如内镜下异物取出术、息肉摘除术、内镜下EMR、ESD术、内镜下空肠置管术、消化道出血的内镜下止血治疗等。尤其是食道静脉曲张破裂出血套扎术和早癌筛查处于苏州市领先地位，早癌诊断率超过20%。另外胶囊内镜及小肠镜检查填补了小肠疾病诊治的盲区。